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高通量测序数据分析高级培训班第二轮通知

2018-03-29


??随着后基因组时代的来临,测序成本不断降低,测序通量不断提升,数以亿计的组学数据不断涌现。高通量测序及其数据分析已经成为研究人类重大疾病及其治疗、预后的重要工具,在生命科学、基础医学等方面具有广泛的应用。怎样快速理解和分析数据,成为科研的难点和关注的焦点。
??我们与其他课程的不同之处是什么呢?
????1. 由科研所分析高通量的研究者们直接指导。
????2. 对实际生信问题进行深入浅出的解析。
????3. 让同学们更好的理解常见图片的统计学和基本做法。

欢迎广大科研同仁及在校学生前来参加!
一、 培训目标及特点:本次培训针对测序技术原理、测序数据分析方法(包括数据认识、数据处理、软件使用、可视化)。以DNA测序分析、RNA测序分析、功能基因组分析为实例,系统讲解高通量测序数据处理方法。讲解生物信息常用软件(Galaxy、IGV、GSEA、R)等的使用方法、了解cBioportal、GEO的常规使用。
二、 培训时间:2018年4月20-21曰
三、 培训地点:四川大学生物治疗国家重点实验室大会议室
四、 主办单位:

??四川省细胞生物学会生物技术专委会

??四川大学生物治疗国家重点实验室

五、 会议费用
??会议注册费800元(包括会议资料等),四川省细胞生物学会会员及生物治疗国家重点实验室学生400元。可转账或现场缴费。所有参会人员差旅费、食宿费用自理。
六、 参会回执

??740017050@qq.com

??回执下载:高通量测序数据分析高级培训班参会回执.docx

七、联系方式
??课程详细安排进一步通知,欢迎大家报名咨询!

??联系电话:18829352688邮箱:740017050@qq.com

主讲专家

??主讲专家为来自四川大学生物治疗国家重点实验室的海外引进教授,国家“青年千人计划 ”获得者,长期从事生物信息领域项目研究,拥有丰富的科研及大数据分析经验,具有资深的 技术底蕴和专业背景。

陈路?研究员 四川大学生物治疗国家重点实验室博士生导师,国家“青年千人计划”学者,国家自然基金委优秀青年,剑桥大学桑格研究所博士后。在Science、Cell(2篇)、Nature、Nature genetics(2篇)等国际学术期刊上共发表19篇,其中影响因子>10的论文 13篇。第一作者的身份共发表论文,包括Science、Cell等。研究方向:综合基因组、转录组、表征遗传组等大数据和生物学实验等方法研究基因调控和疾病发生机理, 开展选择性 剪切在造血干细胞分化、癌症发生和多层面组学等领域中的研究工作,从而揭示癌症、血液 病、自身免疫性等疾病的发病机理。

许恒?研究员 四川大学生物治疗国家重点实验室博士生导师,国家“青年千人计划”学者,国家自然基金委优秀青年,美国 St. Jude 儿童研究医院博士后。目前已在 Nature Genetics、Journal of Clinic Oncology、Journal of National Cancer Institute、 Nature Communications等杂志发表SCI论文22篇(累积影响因子214.6),其中第一作者8篇(累积影响因子99.5)。研究方向:医学遗传学和药物基因组学,任中国药理学协会药物基因组分会常委,中国医药生物技术协会精准医疗分会委员。研究主要以临床—基础—临床的思路,从临床疾病和患者样本入手,对相关的基础生物学实验、生物信息学分析、生物统计学分析,以及基础医学(如药理学)进行交叉学科转化研究。

谢丹?研究员 四川大学生物治疗国家重点实验室博士生导师,国家“青年千人计划”学者,美国斯坦福大学,博士后。目前己在Cell、Nature、Science、Nature?Biotechnology、Genome Research发表多篇论文。研究方向:长期从事基因组学以及生物信息学研究,主要结合近年来迅速发展的第二代测序技术和统计以及机器学习方法,系统深入地研究了多种基因调控机制和基因组间表观遗传谱的差异,揭示了基因调控导致性状差异的分子层面机理,研究成果在恶性肿瘤等重大疾病的基因调控和疾病进程,生物学行为以及恶性肿瘤个性化治疗方面具有很好应用价值。



课程安排
4月20日15:00-18:00会议报到注册(成都市外),生物治疗国家重点实验室大会议室

4月21日7:30-12:00会议报到注册

上午8:30-12:00
1. 课程(二代测序和高通量分析)简介(10分钟)
2. DNA测序分析
??a.DNA测序分析流程和结果介绍

??b.DNA测序常见生物信息图片的解读
3. RNA测序分析

??a.RNA测序分析流程和结果介绍

??b.RNA测序常见生物信息图片的解读
4. 功能基因组分析
??a.功能基因组常见分析流程和结果介绍

??b.功能基因组常见生物信息图片的解读
中午:午餐加应用展示
??1. NGS在精准医学中的应用(安诺优达基因科技(北京)有限公司)
??2. 高通量测序在疾病中的应用或者高通量测序原理(美因基因)
下午13:30-17:30
??1.上机实践13:30-16:30(自备笔记本电脑)
???a) Galaxy生信分析平台
???b) 常用软件的介绍:
????IGV软件分析GSEA数据分析
????cBioportal等网站介绍和应用
???c) R的简单操作

??2.课程答疑:16:30-17:30
??3. 离会:17:30

四川省细胞生物学会

2018年3月29日



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四川省细胞生物学会